Софтуер за микробиология

В допълнение към микроскопите и петриевите блюда, компютрите са важен инструмент за микробиолозите. Софтуерът за микробиологични изследвания включва инструменти, използвани от други научни и инженерни дисциплини, както и специализирани приложения за изследване на бактерии и други микроорганизми. Много приложения, разработени от правителствени агенции, фондации с нестопанска цел или академични изследователи, са на разположение като свободен софтуер за изтегляне и използване, както изисква експериментът или лабораторията.

Инструменти за визуализация
Физическа или умствена картина на суровите данни, които събирате, могат да ви помогнат да разберете по-добре неговото качество, значение и последици. Софтуерът за визуализация на данни с отворен код и търговски данни е широко достъпен за микробиологични изследвания. Създавайте графики и графики на вашите данни, като използвате LibreOffice Calc, Microsoft Excel или системата за визуализация на данни Mondrian. Приложенията Cell-O и RasMol ви помагат да създавате 2D и 3D-анимирани модели на биологично значими молекули като протеини и аминокиселини.

Математическо моделиране
Големите колекции от данни от микробиологията често дават по-смислена информация, след като имат бяха анализирани числено. MATLAB, Octave и SciPy софтуерни пакети, които извършват математическо усъвършенстване, анализ и моделиране на данни на учените. Използвайте тези пакети, за да направите оценка на параметрите чрез приспособяване на кривата, епидемиологични прогнози, симулации на бактериалния растеж и елиминиране на шума от данни или стохастичния ефект. Тези приложения също извършват статистически изчисления, като анализ на дисперсията или тестове за хи-квадрат. ДНК на организма. Фондацията за открита биоинформатика осигурява безплатни приложения за секвениране и анализ на ДНК с отворен код като BioJava и Biopython, които извличат данни от банките за геномна информация, анализират ДНК кода на организма и го сравняват с други ДНК проби. Допълнителните пакети за анализ на генома включват Emboss, HMMER, Clustal Omega, пакет филогенен извод, или PHYLIP, и комплект за манипулиране с последователност, или SMS. регулациите налагат микробиолозите да имат лесен достъп до информацията, която влияе върху тяхната работа. HUGO е търговски пакет, който предоставя на микробиолозите актуална информация за инструменти, химикали, оборудване, културални среди, изисквания за безопасност, нови организми, таксономични промени и антибиотици. В допълнение, микробиолозите, работещи в областта на хранителните науки, могат да използват уеб приложението на браузъра ComBase за достъп до микробиологичните данни, свързани с храните, предоставени от правителствени агенции в Обединеното кралство, Австралия и САЩ.

URL:https://bg.whycomputer.com/Internet/100208339.html